LPC2388のUser's Manualを読む限りでは、VICはリセット後には初期化が済んでおり、とくに触る必要は内容に思えます。しかし、本当にリセット後に初期化を行わない場合、割り込みの動作が不安定になります。したがって、初期化は必須です。
特にVICAddressに0(任意の値でいい)を書き込むのは重要です。User's ManualではVICAddressへの書き込みは「割り込みハンドラから返ったときだけ」に制限されており、それ以外の場合には書くなと明確に禁止されています。しかし、リセット後に書き込まない場合は動作が不定になります。