[Knob-dev 39] biolinux + Alien

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Itoshi NIKAIDO itosh****@nifty*****
2006年 1月 29日 (日) 12:25:43 JST


にかいどうです。

Alien + biolinuxを利用できないか、という話を
調査するということでしたが、結構使えそうです。

Alien
http://kitenet.net/programs/alien/

Biolinux
http://www.biolinux.org/

まず、手動で入れていたPrimer3, MEME, SIM4があります。

また、EMBOSSで利用するデータのRPMがありました。
http://www.biolinux.org/emboss.html

これらを使えばかなり手動の部分をなくし、リマスタリングを
かなり自動化できそうです。

ほかにも魅力的なツールがそろっています。特に系統解析
やRNAの解析関係のものが充実しているようです。

ちなみに、Alienですが、KNOPPIX JPの OpenOffice.org は
RPM をAlienで入れているそうです。

--
Itoshi NIKAIDO, Ph.D.



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