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Projektbeschreibung

mkESA is a program for constructing enhanced suffix arrays (ESAs) from biological sequence data. The program is based on an implementation of Manzini's lightweight Deep-Shallow algorithm, which can also utilize multiple CPUs/cores for extra performance. The generated output is compatible with the output of mkvtree from the Vmatch package.

Systemanforderungen

Die Systemvoraussetzungen sind nicht definiert
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.

2009-07-15 06:05
1.0.4

Diese Pressemitteilung stürzt nicht mehr ab, wenn die Eingabe-Sequenz endet in einem Jokerzeichen.
This release no longer crashes if the input sequence ends in a wildcard character.

2009-07-09 19:34
1.0.3

Eine vordefinierte Alphabet wurde für gemischte DNA hinzugefügt / RNA-Daten. Kleinere Bugfixes und Änderungen angewendet wurden. Das configure-Skript jetzt automatisch den Laufzeit-Linker Suchpfad (rpath).
A predefined alphabet was added for mixed DNA/RNA data. Minor bugfixes and changes have been applied. The configure script now automatically sets the runtime linker search path (rpath).

2009-06-11 21:34
1.0.2

Erste Veröffentlichung auf Freshmeat.
Initial release on Freshmeat.

Project Resources

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