SourceForge Forum
norep****@sourc*****
2014年 4月 4日 (金) 14:31:26 JST
このメールはSourceForge.JPのフォーラムからの自動転送です。 注意: このメールに返信しても単に無視されます。 フォーラムメッセージへの返信は以下のURLにアクセスしてください: https://sourceforge.jp/projects/eos/forums/31695/35256/72402/ 投稿者: kinoshita-eos (kinoshita-eos) 【疑問点】 前処理の回答にて、 > 目的は、方向性を決定することであり、最終的には方向性 を決定すれば、元の画像（ＣＴＦ補正後）をたくさんつか って、ノイズを落としたほうがよいと考えています。 とのことですが、これは角度を完全に決めて３次元像を完 成させてから、元の電顕画像(CTF補正後)(数百枚 ~ 数万枚)を使って出来上がった３次元像のノイズを落として いくという意味でしょうか。(２次元の段階で1枚1枚きっち りノイズを落とすことはせず、３次元像にしてからノイズ を落とす？) 【考察】 「参照付投影角度決定」のMakefileを見ながら、単粒子解析の 流れは以下のようになると考えました。 (処理A) 電顕画像(2Dスタック)(数百枚 ~ 数万枚？) ↓ 前処理(CTF補正、ノイズ除去など) 補正画像(2Dスタック): データA (処理B) PDBファイルまたは元データなし ↓ pdb2mrc, mrcImageCreateなど 参照画像(3D) ↓ mrc3Dto2D 参照投影像(2Dスタック): データB (処理C) (データA) + (データB) ↓ mrcImageAutoRotationCorrelationおよびmakefileのような書き込み 処理 3dInfoファイル(mrc2Dto3D -Iで使用する): データC (処理D) (データA) + (データC) ↓ mrc2Dto3D ３次元像: (データD) (繰り返し処理) データDを新たな参照画像(3D)にする ↓ 処理B - D を繰り返し このループの完了データは前処理後の電顕画像と同程度の ノイズ入り３次元像になると思います。 なので、ここで出来上がった３次元像のノイズ除去を行う 処理を入れるないようにしようと思っています。 ______________________________________________________________________ Eos-Image Analysis Environment プロジェクトはフォーラムへの投稿をプロジェクトメンバーに メール送信するように設定されています。 設定の詳細に関しては、プロジェクト管理者に確認してください。
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