The Staden Package is a set of interactive tools
for DNA sequence assembly and editing, as well as
DNA and protein sequence analysis, the best known
of which is "gap4".
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.
Die wichtigsten Änderungen in dieser Version, zusätzlich zu den üblichen Runde von Bugfixes, sind die Unterstützung in Gap4 für sehr große Datenbanken (64-Bit-Datei-Größen), Unterstützung für die Spuren der "454"-Instrument und die Unterstützung für eine neue SNP-Kandidaten Grundstück, so dass wahrscheinlich Visualisierung von SNPs oder komprimiert wiederholt und Tools, um diese in ihre Bestandteile aufgeteilt Haplotypen. Darüber hinaus wurden erhebliche Verbesserungen in der Geschwindigkeit gemacht.
Tags:
Minor feature enhancements
The main changes in this release, in addition to
the usual round of bugfixes, are the support in
Gap4 for very large databases (64-bit file sizes),
support for traces from the "454" instrument, and
support for a new SNP Candidates plot, allowing
visualization of likely SNPs or collapsed repeats
and tools to split these into their constituent
haplotypes. In addition, substantial speed
improvements have been made.
In erster Linie Gap4 Änderungen. Dazu gehören neue Flächen-und Suchfunktionen zur Sequenzvariationen (oder misassemblies Highlight), Vorlage Status Verbesserungen, und eine Vielzahl von kleineren Anpassungen und Bugfixes.
Tags:
Minor feature enhancements
Primarily Gap4 changes. This includes new plots and search functions designed to highlight sequence variations (or misassemblies), template status improvements, and a multitude of more minor adjustments and bugfixes.
