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Projektbeschreibung

relax is a program designed for the study of the dynamics of proteins and other macromolecules though the analysis of experimental NMR data. It supports exponential curve fitting for the calculation of the R1 and R2 relaxation rates, calculation of the NOE, reduced spectral density mapping, the Lipari and Szabo model-free analysis, study of domain motions via the N-state model (or ensemble analysis) and frame order dynamics theories using anisotropic NMR parameters such as RDCs and PCSs, the investigation of stereochemistry in dynamic ensembles, and the analysis of relaxation dispersion.

Systemanforderungen

Die Systemvoraussetzungen sind nicht definiert
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2013-02-14 07:23
2.2.2

Dies ist eine kleine Bugfix-Release, das behebt ein wichtiges Thema, irgendwo in den letzten, den wenigen Versionen entspannen wobei fehlende Entspannung Daten nicht korrekt in einer Modell-freie Analyse behandelt wird, eingeführt. Auch wurden einige andere kleine Bugs behoben.
Tags: Minor bugfixes
This is a minor bugfix release that resolves an important issue, introduced somewhere within the last few relax releases, whereby missing relaxation data is not handled properly in a model-free analysis. A number of other small bugs have also been fixed.

2013-02-02 18:02
2.2.1

Diese Version löste eine Reihe von Themen, einschließlich Python 3 Fragen, PDB und Handhabung, Struktur und fehlende Entspannung Daten Modell-freie Analysen fehlschlagen verursachen. Auf diese neueste Version zu aktualisieren, wird dringend empfohlen.
Tags: Major bugfixes
This release solved a number of issues, including Python 3 issues, PDB and structure handling, and missing relaxation data causing model-free analyses to fail. Upgrading to this newest version is highly recommended.

2013-01-29 07:37
2.2.0

Dies ist eine wichtige Funktion und Bugfix-Version, die die Fertigstellung der N-Zustand Modell Analyse Umsetzung ist. Das N-Zustandsmodell ermöglicht einzelne Strukturen oder Ensembles von statischen Strukturen werden analysiert und verglichen mit residual dipolar Kupplungen (RDCs), pseudo-contact Schichten (PCSs) und Distanz Fesseln über Noe. Neben der Ausrichtung Tensoren können die Populationen oder Wahrscheinlichkeiten für die einzelnen Zustände optimiert werden sowie die Position der paramagnetischen Mitte wenn PCSs verwendet werden.
Tags: major feature release, Major bugfixes
This is a major feature and bugfix release that marks the completion of the N-state model analysis implementation. The N-state model allows single structures or ensembles of static structures to be analyzed and compared using residual dipolar couplings (RDCs), pseudo-contact shifts (PCSs), and distance restraints via NOEs. In addition to alignment tensors, the populations or probabilities of each state can be optimized, as well as the position of the paramagnetic center when PCSs are used.

2011-11-15 12:07
1.3.13

Dies ist die zweite Version von der Entspannung GUI und ist eine wichtige Code neu. Es jetzt auf GNU/Linux, Mac OS X und MS Windows funktionsfähig. Zusätzlich zu viele Bugfixes sind Verbesserungen bei der Frame Ordnung Theorie, N-Zustand Modellanalyse, Umgang mit RDC und PCS Werten, eine Reihe neuer Benutzer Funktionen für Struktur Schaffung, Vertreibung und Überlagerung und Modell-freie Ergebnis Visualisierung in PyMOL und ein Redesign der Auto-Analysen haben alle Eingabedaten Pre-Loaded in eine Datenpipe Entspannung für die Unterstützung von nicht-Protein organischen Molekülen in der Dauvergne_protocol Auto-Analyse.
Tags: major feature release, gui release, major bug fixes
This is the second version of the relax GUI, and is a major code rewrite. It now functional on GNU/Linux, Mac OS X, and MS Windows. In addition to many bugfixes, there are improvements to the frame order theory, N-state model analysis, handling of RDC and PCS values, a number of new user functions for structure creation, displacement, and superimposition and for model-free result visualisation in PyMOL, and a redesign of the auto-analyses to have all input data pre-loaded into a relax data pipe for support of non-protein organic molecules in the dauvergne_protocol auto-analysis.

2011-08-24 21:13
1.3.12

Dies ist eine große Feature-Release. Es fügt die Fähigkeit zu laufen entspannen Sie sich auf Clustern oder Netzen von Rechnern über das MPI-Protokoll. Dies geht in Gary Thompson Multi-Prozessor-Zweig, der den ganzen Weg begonnen wurde im Jahr 2007. Die "Multi"-Paket enthält zwei Prozessor Stoffe, die Standard-Uni-Prozessor-Modus und die mpi4py-Modus für die Verwendung des MPI-Protokoll mit Python. Das Modell-free-Analyse-Code wurde parallelisiert, die Vorteile der Multi-Prozessor-Modi zu nehmen, erheblich beschleunigen Berechnungen auf Clustern mit nahezu perfekte Skalierung Effizienz.
Tags: major feature release
This is a major feature release. It adds the ability to run relax on clusters or grids of computers via the MPI protocol. This merges in Gary Thompson's multi-processor branch, which was started all the way back in 2007. The "multi" package introduces two processor fabrics, the standard uni-processor mode and the mpi4py mode for using the MPI protocol with Python. The model-free analysis code has been parallelized to take advantage of the multi-processor modes, significantly speeding up calculations on clusters with near perfect scaling efficiency.

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